Meilleur logiciel Facturation Agréé pour TPE et PME
Pourquoi ce comparatif ?
La réforme de la facturation électronique 2026 arrive à grands pas. Dès septembre 2026, toutes les TPE et PME devront être capables de recevoir des factures électroniques. Et à partir de septembre 2027, elles devront également les émettre.
Face à cette obligation, le choix du bon logiciel est crucial. Mais avec plus de 80 plateformes agréées par la DGFIP, difficile de s'y retrouver. C'est pourquoi on a testé et comparé les 11 meilleures solutions adaptées aux TPE et PME françaises.
Notre objectif : vous aider à trouver l'outil qui correspond à vos besoins, votre budget et votre secteur d'activité.
- Test de chaque solution pendant minimum 5 jours avec un compte réel ou démo
- Émission et réception de factures électroniques au format Factur-X
- Évaluation de l'interface utilisateur et de la courbe d'apprentissage
- Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
- Analyse du rapport qualité/prix et des fonctionnalités incluses
- Contact du support client pour évaluer la réactivité
Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.
Notre classement

PENNYLANE
Meilleur choixPennylane est une plateforme tout-en-un de gestion financière et comptable conçue pour les TPE, PME et experts-comptables français. Immatriculée comme Plateforme Agréée depuis 2024, elle permet déjà d'émettre et recevoir des factures électroniques au format Factur-X sans surcoût, avec intégration native de toutes les fonctionnalités comptables : facturation illimitée, compte pro avec IBAN français, synchronisation bancaire automatique avec plus de 100 banques, suivi de trésorerie en temps réel, gestion des notes de frais et collaboration directe avec votre expert-comptable. La solution centralise l'ensemble des données financières pour offrir une vue unifiée et automatisée de la situation comptable, permettant aux dirigeants de prendre des décisions éclairées basées sur des informations actualisées. Avec plus de 4 500 cabinets comptables partenaires et une valorisation de 2 milliards d'euros suite à sa levée de 75 millions en 2025, Pennylane s'impose comme le leader français de la transformation digitale comptable.
Points forts
- Interface moderne et intuitive, synchronisation bancaire temps réel avec 350+ banques
- Collaboration cabinet-client fluide avec espace partagé et validation des écritures
- Automatisation poussée : OCR, rapprochement bancaire, pré-comptabilisation IA
À savoir
- Tarification progressive qui peut grimper avec le volume de transactions
- Courbe d'apprentissage pour les experts-comptables habitués aux outils traditionnels
- Fonctionnalités CRM et devis moins avancées que les solutions spécialisées

Axonaut
Excellent rapport qualité/prixAxonaut est un logiciel de gestion tout-en-un français pour TPE et PME qui centralise CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité, compte pro et bien plus dans une interface intuitive et accessible.
Points forts
- Solution 100% française tout-en-un : CRM, facturation, trésorerie, stock, comptabilité dans une interface intuitive
- 320 000 utilisateurs : adoptée par plus de 12 000 entreprises françaises
- Application mobile complète (iOS/Android) avec API REST et connecteur MCP
À savoir
- Trop complet pour les micro-entreprises n'ayant besoin que de facturation simple
- Fonctionnalités limitées pour ETI et grands comptes nécessitant un ERP
- Intégrations tierces moins nombreuses que les leaders internationaux

Sellsy
Alternative solideSellsy est un logiciel français tout-en-un qui centralise CRM, facturation, trésorerie et pré-comptabilité dans une interface intuitive. Destiné aux TPE et PME, il permet de gérer devis, factures, abonnements récurrents, paiements en ligne (Stripe, GoCardless), relances automatiques et rapprochement bancaire. Rachetée par TeamSystem en septembre 2025, la plateforme compte plus de 23 000 entreprises clientes et 180 collaborateurs. Sellsy est immatriculée Plateforme Agréée (PA) pour la facturation électronique obligatoire 2026, avec formats structurés (Factur-X, UBL, CII) inclus sans surcoût. L'IA intégrée accélère la rédaction de devis et relances. Solution idéale pour facturer plus vite, encaisser plus tôt et piloter son activité en temps réel.
Points forts
- CRM complet avec pipeline commercial visuel et automatisations marketing
- Suite intégrée : prospection → devis → facture → comptabilité sans ressaisie
- 35 000 entreprises clientes, support français réactif basé à La Rochelle
À savoir
- Interface parfois dense avec beaucoup de fonctionnalités à maîtriser
- Tarif par utilisateur qui peut peser pour les équipes nombreuses
- Reporting avancé réservé aux formules supérieures
Alternatives
Tableau comparatif
| Outil | Facturation | Français | Mobile | API | CRM | Compta | Illimité |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() |
Comment choisir son logiciel de facturation ?
Avant de vous lancer, posez-vous les bonnes questions. Votre choix dépend de plusieurs critères essentiels.
Critères essentiels
5 points positifs
- Statut PA/PDP confirmé sur le registre DGFIP
- Support des formats Factur-X, UBL ou CII
- Archivage légal 10 ans inclus
- Support client en français et réactif
- Prix adapté à votre volume de factures
Points d'attention
4 points d'attention
- Méfiez-vous des offres "gratuites" avec coûts cachés
- Vérifiez la compatibilité avec votre logiciel comptable
- Attention aux tarifs qui explosent avec le volume
- Évitez les solutions sans mobile si vous êtes souvent en déplacement
Notre conseil
- Commencez par tester 2-3 solutions en version d'essai gratuit. Ne vous engagez pas sur la base d'une démo commerciale uniquement. Testez avec vos propres données et vos cas d'usage réels.
Questions fréquentes
Questions fréquentes
Informations vérifiées le 05/02/2026
- Liste officielle des PA/PDP — DGFIP - Registre officiel
- Calendrier de la réforme — Ministère de l'Économie
- Format Factur-X — FNFE-MPE







