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FE2026
Micro-entreprise

Meilleur logiciel Facturation Agréé pour Micro-entreprise

Vous dirigez une micro-entreprise et cherchez un logiciel de facturation électronique adapté au régime micro-fiscal ? On a testé et comparé 8 solutions agréées PA/PDP avec gestion simplifiée.
Ilan Lemos
Ilan Lemos1 min de lecture

Pourquoi ce comparatif pour les micro-entreprises ?

Le statut de micro-entreprise (anciennement auto-entrepreneur) offre une gestion simplifiée avec un régime micro-fiscal avantageux. Mais cette simplicité doit se retrouver dans vos outils de facturation.

Avec la réforme de la facturation électronique 2026, les micro-entreprises doivent s'équiper d'un logiciel conforme. La bonne nouvelle : plusieurs solutions sont spécialement conçues pour gérer les spécificités du régime micro (franchise TVA, abattement forfaitaire, seuils de CA).

On a testé 8 logiciels adaptés aux micro-entreprises, en évaluant leur gestion du régime micro-fiscal et leur facilité d'utilisation.

Méthodologie de test
  • Test de chaque solution en configuration régime micro-fiscal
  • Évaluation de la gestion de la franchise de TVA et des seuils
  • Test des fonctionnalités de suivi du chiffre d'affaires et alertes seuils
  • Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
  • Analyse du rapport qualité/prix pour les petits volumes
  • Test de la génération des déclarations URSSAF

Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.

Notre classement

Logo INDY

INDY

Meilleur choix
Gratuit

Indy est la solution comptable n°1 des indépendants français avec 200 000+ utilisateurs et note 4.7 Trustpilot. Basée à Lyon, Indy propose une plateforme complète officiellement immatriculée Plateforme Agréée pour la réforme 2026. L'offre Essentiel 100% gratuite inclut comptabilité automatisée (synchronisation bancaire, IA catégorisation, détection TVA), facturation conforme 2026, compte pro gratuit (IBAN FR, carte Mastercard, virements instantanés) et suivi temps réel. Formules payantes: Plus 9€/mois (fonctionnalités avancées pilotage) et Premium dès 12€/mois (déclarations obligatoires avec spécialistes). Cibles: auto-entrepreneurs, EI BNC, SAS/SASU, SARL/EURL <247k€ CA services ou <840k€ vente, SCI, LMNP. Support client 5 étoiles réponse <2min chat avec conseillers experts. Applications mobiles iOS (4.9) et Android (4.8) pour gestion nomade. Création entreprise offerte avec accompagnement gratuit spécialistes choix statut. Garantie satisfait ou remboursé 30 jours sans engagement.

Points forts

  • Spécialisé indépendants : BNC, micro-entreprise, professions libérales
  • Automatisation 2035/2042 : déclarations fiscales pré-remplies
  • Synchronisation bancaire et catégorisation automatique des transactions

À savoir

  • Limité aux structures simples (pas pour SARL/SAS avec salariés)
  • Fonctionnalités de facturation basiques comparé aux solutions PME
  • Pas adapté aux activités avec stock ou gestion commerciale complexe
Logo TIIME PDP

TIIME PDP

Excellent rapport qualité/prix
Gratuit

TIIME PDP est la seule plateforme agréée de facturation électronique 100% gratuite en France, immatriculée sous le numéro 0037 par la DGFiP. Conçue spécifiquement pour les indépendants, freelances, TPE et PME, TIIME propose une solution complète intégrant facturation électronique, comptabilité, compte professionnel et e-reporting dans un seul outil centralisé. Avec plus de 300 000 entrepreneurs utilisateurs et une note exceptionnelle de 4,8/5 sur plus de 4 700 avis, TIIME se distingue par sa simplicité d'utilisation et son accompagnement pas à pas. La plateforme est certifiée ISO 27001 et SecNumCloud, garantissant la sécurité des données, et est interopérable Peppol pour les échanges européens. Contrairement à la plupart des concurrents, TIIME maintient sa gratuité totale sans frais cachés pour l'émission et la réception de factures électroniques.

Points forts

  • 100% gratuit pour les micro-entrepreneurs et indépendants
  • Interface simple et épurée, prise en main immédiate
  • Conformité 2026 incluse sans surcoût

À savoir

  • Fonctionnalités limitées pour les structures plus complexes
  • Pas de CRM ni de gestion commerciale avancée
  • Support limité sur la version gratuite
Logo Abby

Abby

Alternative solide
Gratuit (Pro dès 4€/mois)

Abby est la Plateforme Agréée n°1 des micro-entrepreneurs et indépendants, utilisée par plus de 100 000 professionnels. L'application centralise facturation illimitée, suivi de trésorerie, gestion de TVA et déclarations URSSAF dans une interface simple et gratuite. Partenaire officiel de l'URSSAF, Abby permet de se mettre en conformité avec la réforme 2026 en quelques clics.

Points forts

  • Conçu spécifiquement pour les auto-entrepreneurs et micro-entreprises
  • Déclaration URSSAF intégrée et automatisée
  • Interface très simple, idéale pour les débutants

À savoir

  • Limité aux micro-entreprises uniquement
  • Fonctionnalités réduites comparé aux solutions pro
  • Pas adapté dès que l'activité se développe

Alternatives

4
Logo PENNYLANE

PENNYLANE

Pennylane est une plateforme tout-en-un de gestion financière et comptable conçue pour les TPE, PME et experts-comptables français. Immatriculée comme Plateforme Agréée depuis 2024, elle permet déjà d'émettre et recevoir des factures électroniques au format Factur-X sans surcoût, avec intégration native de toutes les fonctionnalités comptables : facturation illimitée, compte pro avec IBAN français, synchronisation bancaire automatique avec plus de 100 banques, suivi de trésorerie en temps réel, gestion des notes de frais et collaboration directe avec votre expert-comptable. La solution centralise l'ensemble des données financières pour offrir une vue unifiée et automatisée de la situation comptable, permettant aux dirigeants de prendre des décisions éclairées basées sur des informations actualisées. Avec plus de 4 500 cabinets comptables partenaires et une valorisation de 2 milliards d'euros suite à sa levée de 75 millions en 2025, Pennylane s'impose comme le leader français de la transformation digitale comptable.

5
Logo QONTO

QONTO

Qonto est une néobanque professionnelle française immatriculée Plateforme Agréée (PA n°23) par la DGFiP pour la facturation électronique obligatoire 2026. Elle combine compte professionnel et logiciel de facturation conforme au format Factur-X dans une interface unique. La solution permet de créer, envoyer et recevoir des factures électroniques en conformité réglementaire, tout en centralisant la gestion bancaire et comptable. Qonto se distingue par son approche tout-en-un incluant la facturation électronique sans surcoût dans tous ses forfaits, des virements instantanés, plus de 80 intégrations tierces, et un accès comptable direct. Particulièrement adaptée aux TPE-PME de 5 à 50 salariés, la plateforme offre une transition simple vers la conformité 2026 avec un accompagnement dédié et une interface pensée pour les entrepreneurs.

7
Logo Sellsy

Sellsy

Sellsy est un logiciel français tout-en-un qui centralise CRM, facturation, trésorerie et pré-comptabilité dans une interface intuitive. Destiné aux TPE et PME, il permet de gérer devis, factures, abonnements récurrents, paiements en ligne (Stripe, GoCardless), relances automatiques et rapprochement bancaire. Rachetée par TeamSystem en septembre 2025, la plateforme compte plus de 23 000 entreprises clientes et 180 collaborateurs. Sellsy est immatriculée Plateforme Agréée (PA) pour la facturation électronique obligatoire 2026, avec formats structurés (Factur-X, UBL, CII) inclus sans surcoût. L'IA intégrée accélère la rédaction de devis et relances. Solution idéale pour facturer plus vite, encaisser plus tôt et piloter son activité en temps réel.

Tableau comparatif

OutilFacturationFrançaisMobileAPICRMComptaIllimité
INDY
INDY
TIIME PDP
TIIME PDP
Abby
Abby
PENNYLANE
PENNYLANE
QONTO
QONTO
Axonaut
Axonaut
Sellsy
Sellsy
@N2F PDP
@N2F PDP

Comment choisir son logiciel en micro-entreprise ?

Le choix du logiciel dépend de votre activité et de vos besoins spécifiques en tant que micro-entrepreneur.

Critères essentiels pour micro-entreprise

5 points positifs

  • Gestion automatique du régime micro-fiscal
  • Suivi du CA avec alertes de dépassement de seuils
  • Génération des données pour la déclaration URSSAF
  • Interface simple adaptée aux non-comptables
  • Statut PA/PDP pour la conformité 2026

Points d'attention

4 points d'attention

  • Vérifiez la gestion correcte de la mention TVA non applicable
  • Attention aux fonctionnalités comptables inutiles en régime micro
  • Évitez les solutions trop complexes pour votre besoin
  • Assurez-vous que le passage au réel est géré si vous dépassez les seuils

Notre conseil

  • Pour une micro-entreprise, Indy est idéal : il gère parfaitement le régime micro, calcule vos cotisations URSSAF et vous alerte en cas de dépassement de seuils. Tiime et Abby sont d'excellentes alternatives gratuites.

Questions fréquentes

Questions fréquentes

C'est le même statut ! Depuis 2016, le terme 'auto-entrepreneur' a été remplacé par 'micro-entrepreneur'. Les deux désignent le même régime simplifié avec un plafond de chiffre d'affaires et une comptabilité allégée.
Oui. Toutes les micro-entreprises assujetties à la TVA (même en franchise) sont concernées. Réception obligatoire dès septembre 2026, émission obligatoire à partir de septembre 2027.
Les plafonds de CA 2026 sont : 188 700€ pour l'achat/vente de marchandises, 77 700€ pour les prestations de services et professions libérales, 15 000€ pour les locations meublées de tourisme non classés. Les seuils de franchise TVA sont plus bas : 85 000€ (vente) et 37 500€ (services).
Certains logiciels comme Indy ou Tiime peuvent calculer vos cotisations URSSAF et pré-remplir votre déclaration. Très pratique pour gagner du temps et éviter les erreurs.
Vous sortez du régime micro et passez au régime réel. Les bons logiciels gèrent cette transition et vous alertent en amont. Certains comme Pennylane ou Indy peuvent continuer à vous accompagner au régime réel.
Pour la plupart des micro-entreprises, oui. Des solutions comme Abby ou Tiime offrent des fonctionnalités gratuites largement suffisantes : facturation, devis, suivi des paiements, et conformité 2026.
Sources

Informations vérifiées le 05/02/2026