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FE2026
Auto-entrepreneur

Meilleur logiciel Facturation Agréé pour Auto-entrepreneur

Vous êtes auto-entrepreneur et cherchez un logiciel de facturation électronique simple et abordable ? On a testé et comparé 8 solutions agréées PA/PDP adaptées aux freelances et micro-entrepreneurs.
Ilan Lemos
Ilan Lemos1 min de lecture

Pourquoi ce comparatif pour les auto-entrepreneurs ?

En tant qu'auto-entrepreneur (ou micro-entrepreneur), vous avez des besoins spécifiques : un logiciel simple à utiliser, abordable, et qui gère automatiquement les spécificités de votre régime fiscal (franchise de TVA, plafonds de chiffre d'affaires, etc.).

Avec la réforme de la facturation électronique 2026, vous devrez être capable de recevoir des factures électroniques dès septembre 2026, et d'en émettre à partir de septembre 2027. Pas de panique : plusieurs solutions sont parfaitement adaptées à votre activité.

On a testé 8 logiciels particulièrement pertinents pour les auto-entrepreneurs et freelances, en évaluant leur simplicité, leur prix, et leur conformité à la réforme.

Méthodologie de test
  • Test de chaque solution avec un compte réel en configuration auto-entrepreneur
  • Évaluation de la gestion de la franchise de TVA et des mentions obligatoires
  • Test de la simplicité d'utilisation et du temps de création d'une facture
  • Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
  • Analyse du rapport qualité/prix (offres gratuites vs payantes)
  • Test de l'application mobile pour la facturation en déplacement

Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.

Notre classement

Logo INDY

INDY

Meilleur choix
Gratuit

Indy est la solution comptable n°1 des indépendants français avec 200 000+ utilisateurs et note 4.7 Trustpilot. Basée à Lyon, Indy propose une plateforme complète officiellement immatriculée Plateforme Agréée pour la réforme 2026. L'offre Essentiel 100% gratuite inclut comptabilité automatisée (synchronisation bancaire, IA catégorisation, détection TVA), facturation conforme 2026, compte pro gratuit (IBAN FR, carte Mastercard, virements instantanés) et suivi temps réel. Formules payantes: Plus 9€/mois (fonctionnalités avancées pilotage) et Premium dès 12€/mois (déclarations obligatoires avec spécialistes). Cibles: auto-entrepreneurs, EI BNC, SAS/SASU, SARL/EURL <247k€ CA services ou <840k€ vente, SCI, LMNP. Support client 5 étoiles réponse <2min chat avec conseillers experts. Applications mobiles iOS (4.9) et Android (4.8) pour gestion nomade. Création entreprise offerte avec accompagnement gratuit spécialistes choix statut. Garantie satisfait ou remboursé 30 jours sans engagement.

Points forts

  • Spécialisé indépendants : BNC, micro-entreprise, professions libérales
  • Automatisation 2035/2042 : déclarations fiscales pré-remplies
  • Synchronisation bancaire et catégorisation automatique des transactions

À savoir

  • Limité aux structures simples (pas pour SARL/SAS avec salariés)
  • Fonctionnalités de facturation basiques comparé aux solutions PME
  • Pas adapté aux activités avec stock ou gestion commerciale complexe
Logo Abby

Abby

Excellent rapport qualité/prix
Gratuit (Pro dès 4€/mois)

Abby est la Plateforme Agréée n°1 des micro-entrepreneurs et indépendants, utilisée par plus de 100 000 professionnels. L'application centralise facturation illimitée, suivi de trésorerie, gestion de TVA et déclarations URSSAF dans une interface simple et gratuite. Partenaire officiel de l'URSSAF, Abby permet de se mettre en conformité avec la réforme 2026 en quelques clics.

Points forts

  • Conçu spécifiquement pour les auto-entrepreneurs et micro-entreprises
  • Déclaration URSSAF intégrée et automatisée
  • Interface très simple, idéale pour les débutants

À savoir

  • Limité aux micro-entreprises uniquement
  • Fonctionnalités réduites comparé aux solutions pro
  • Pas adapté dès que l'activité se développe
Logo TIIME PDP

TIIME PDP

Alternative solide
Gratuit

TIIME PDP est la seule plateforme agréée de facturation électronique 100% gratuite en France, immatriculée sous le numéro 0037 par la DGFiP. Conçue spécifiquement pour les indépendants, freelances, TPE et PME, TIIME propose une solution complète intégrant facturation électronique, comptabilité, compte professionnel et e-reporting dans un seul outil centralisé. Avec plus de 300 000 entrepreneurs utilisateurs et une note exceptionnelle de 4,8/5 sur plus de 4 700 avis, TIIME se distingue par sa simplicité d'utilisation et son accompagnement pas à pas. La plateforme est certifiée ISO 27001 et SecNumCloud, garantissant la sécurité des données, et est interopérable Peppol pour les échanges européens. Contrairement à la plupart des concurrents, TIIME maintient sa gratuité totale sans frais cachés pour l'émission et la réception de factures électroniques.

Points forts

  • 100% gratuit pour les micro-entrepreneurs et indépendants
  • Interface simple et épurée, prise en main immédiate
  • Conformité 2026 incluse sans surcoût

À savoir

  • Fonctionnalités limitées pour les structures plus complexes
  • Pas de CRM ni de gestion commerciale avancée
  • Support limité sur la version gratuite

Alternatives

4
Logo PENNYLANE

PENNYLANE

Pennylane est une plateforme tout-en-un de gestion financière et comptable conçue pour les TPE, PME et experts-comptables français. Immatriculée comme Plateforme Agréée depuis 2024, elle permet déjà d'émettre et recevoir des factures électroniques au format Factur-X sans surcoût, avec intégration native de toutes les fonctionnalités comptables : facturation illimitée, compte pro avec IBAN français, synchronisation bancaire automatique avec plus de 100 banques, suivi de trésorerie en temps réel, gestion des notes de frais et collaboration directe avec votre expert-comptable. La solution centralise l'ensemble des données financières pour offrir une vue unifiée et automatisée de la situation comptable, permettant aux dirigeants de prendre des décisions éclairées basées sur des informations actualisées. Avec plus de 4 500 cabinets comptables partenaires et une valorisation de 2 milliards d'euros suite à sa levée de 75 millions en 2025, Pennylane s'impose comme le leader français de la transformation digitale comptable.

6
Logo QONTO

QONTO

Qonto est une néobanque professionnelle française immatriculée Plateforme Agréée (PA n°23) par la DGFiP pour la facturation électronique obligatoire 2026. Elle combine compte professionnel et logiciel de facturation conforme au format Factur-X dans une interface unique. La solution permet de créer, envoyer et recevoir des factures électroniques en conformité réglementaire, tout en centralisant la gestion bancaire et comptable. Qonto se distingue par son approche tout-en-un incluant la facturation électronique sans surcoût dans tous ses forfaits, des virements instantanés, plus de 80 intégrations tierces, et un accès comptable direct. Particulièrement adaptée aux TPE-PME de 5 à 50 salariés, la plateforme offre une transition simple vers la conformité 2026 avec un accompagnement dédié et une interface pensée pour les entrepreneurs.

7
Logo Sellsy

Sellsy

Sellsy est un logiciel français tout-en-un qui centralise CRM, facturation, trésorerie et pré-comptabilité dans une interface intuitive. Destiné aux TPE et PME, il permet de gérer devis, factures, abonnements récurrents, paiements en ligne (Stripe, GoCardless), relances automatiques et rapprochement bancaire. Rachetée par TeamSystem en septembre 2025, la plateforme compte plus de 23 000 entreprises clientes et 180 collaborateurs. Sellsy est immatriculée Plateforme Agréée (PA) pour la facturation électronique obligatoire 2026, avec formats structurés (Factur-X, UBL, CII) inclus sans surcoût. L'IA intégrée accélère la rédaction de devis et relances. Solution idéale pour facturer plus vite, encaisser plus tôt et piloter son activité en temps réel.

Tableau comparatif

OutilFacturationFrançaisMobileAPICRMComptaIllimité
INDY
INDY
Abby
Abby
TIIME PDP
TIIME PDP
PENNYLANE
PENNYLANE
Axonaut
Axonaut
QONTO
QONTO
Sellsy
Sellsy
@N2F PDP
@N2F PDP

Comment choisir son logiciel quand on est auto-entrepreneur ?

En tant qu'auto-entrepreneur, vos critères de choix sont différents d'une PME. Voici ce qui compte vraiment.

Critères essentiels pour auto-entrepreneur

5 points positifs

  • Gestion automatique de la franchise de TVA (mention obligatoire)
  • Interface simple et rapide (création de facture en moins de 2 min)
  • Application mobile fonctionnelle pour facturer en déplacement
  • Prix adapté (offre gratuite ou à moins de 15€/mois)
  • Statut PA/PDP confirmé pour la conformité 2026

Points d'attention

4 points d'attention

  • Évitez les logiciels trop complexes pensés pour les PME
  • Vérifiez que la mention TVA non applicable est bien gérée
  • Attention aux offres gratuites avec fonctionnalités limitées
  • Assurez-vous que le logiciel gère bien le passage à la TVA

Notre conseil

  • Pour un auto-entrepreneur, la simplicité prime. Indy est notre recommandation : interface intuitive, gestion automatique de la franchise TVA, et tarif très abordable. Abby et Tiime sont d'excellentes alternatives gratuites pour démarrer.

Questions fréquentes

Questions fréquentes

Oui. Tous les auto-entrepreneurs assujettis à la TVA (même en franchise de base) sont concernés par la réforme. Dès le 1er septembre 2026, vous devrez pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée. L'émission sera obligatoire à partir du 1er septembre 2027.
Abby et Tiime proposent des offres gratuites très complètes pour les auto-entrepreneurs. Abby est spécialement conçu pour les micro-entrepreneurs avec une note de 4.8/5 sur Trustpilot. Indy propose également une formule très abordable avec plus de 5700 avis positifs.
Les logiciels adaptés aux auto-entrepreneurs ajoutent automatiquement la mention 'TVA non applicable, article 293 B du CGI' sur vos factures. Vous n'avez rien à configurer manuellement.
Les seuils 2026 sont : 77 700€ pour les prestations de services, 188 700€ pour l'achat/vente. En cas de dépassement deux années consécutives, vous passez au régime réel l'année suivante. Les seuils de franchise TVA sont plus bas : 37 500€ (services) et 85 000€ (vente).
Le non-respect de l'obligation de facturation électronique expose à une amende forfaitaire de 15€ par facture non transmise au format électronique. En cas de manquement répété, l'amende peut atteindre 75 000€ pour les entreprises individuelles.
Oui. À partir de 2026, un simple PDF ne suffit plus. Vous devez utiliser un logiciel capable de générer des factures au format Factur-X (fichier structuré) et de les transmettre via une plateforme agréée PDP ou le portail public PPF.
À partir de juillet 2027, quatre nouvelles mentions deviennent obligatoires : le numéro SIREN de votre client (s'il est en France), l'adresse de livraison si différente de l'adresse de facturation, la catégorie de l'opération facturée, et la mention 'Option pour le paiement de la taxe d'après les débits' si applicable.
Sources

Informations vérifiées le 05/02/2026