Meilleur logiciel Facturation Agréé Multi-segments
Pourquoi ce comparatif multi-segments ?
Vous dirigez un groupe de sociétés, une holding, ou une entreprise avec plusieurs activités distinctes ? La réforme de la facturation électronique 2026 complexifie votre gestion : chaque entité juridique doit être conforme, avec ses propres obligations TVA et son propre numéro SIREN.
Le défi est de taille : comment centraliser la gestion tout en respectant l'autonomie comptable de chaque structure ? Comment éviter les doubles saisies et obtenir une vision consolidée de vos données financières ?
Nous avons testé 10 solutions capables de gérer cette complexité, en évaluant leur capacité à piloter plusieurs entités depuis une interface unique tout en garantissant la conformité de chacune.
- Test de chaque solution avec minimum 3 entités juridiques distinctes
- Évaluation de la gestion multi-SIREN et multi-numéros de TVA
- Analyse des workflows inter-sociétés (facturation intra-groupe)
- Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
- Test de la consolidation des données et des tableaux de bord groupe
- Évaluation des droits d'accès par entité et par utilisateur
Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.
Notre classement

Sellsy
Meilleur choixSellsy est un logiciel français tout-en-un qui centralise CRM, facturation, trésorerie et pré-comptabilité dans une interface intuitive. Destiné aux TPE et PME, il permet de gérer devis, factures, abonnements récurrents, paiements en ligne (Stripe, GoCardless), relances automatiques et rapprochement bancaire. Rachetée par TeamSystem en septembre 2025, la plateforme compte plus de 23 000 entreprises clientes et 180 collaborateurs. Sellsy est immatriculée Plateforme Agréée (PA) pour la facturation électronique obligatoire 2026, avec formats structurés (Factur-X, UBL, CII) inclus sans surcoût. L'IA intégrée accélère la rédaction de devis et relances. Solution idéale pour facturer plus vite, encaisser plus tôt et piloter son activité en temps réel.
Points forts
- CRM complet avec pipeline commercial visuel et automatisations marketing
- Suite intégrée : prospection → devis → facture → comptabilité sans ressaisie
- 35 000 entreprises clientes, support français réactif basé à La Rochelle
À savoir
- Interface parfois dense avec beaucoup de fonctionnalités à maîtriser
- Tarif par utilisateur qui peut peser pour les équipes nombreuses
- Reporting avancé réservé aux formules supérieures

CEGID
Excellent rapport qualité/prixCegid, leader français des solutions de gestion basé à Lyon avec 5 000 collaborateurs et 500 000+ clients, propose une Plateforme Agréée (ex-PDP) immatriculée numéro 0007 par la DGFiP pour la facturation électronique obligatoire 2026-2027. Fort de 10 ans d'expérience PDP au Portugal avec 230 millions de documents traités annuellement, Cegid offre une solution bout-en-bout intégrant nativement toutes ses solutions de gestion (Cegid et EBP) et gérant les flux complets : création facture, émission, transmission via réseau PEPPOL (Cegid est AccessPoint certifié). La plateforme supporte tous formats obligatoires (Factur-X, UBL, CII) et formats EDI-Fact existants, garantit conformité complète e-invoicing et e-reporting, et offre fonctionnalités avancées : automatisation rappels, suivi cycle vie factures, contrôles conformité automatiques, gestion factures B2C et internationales hors champ réforme. Interface intuitive priviligiant l'expérience utilisateur avec intégration transparente ERP existants.
Points forts
- Gamme complète : TPE → Grands comptes, tous secteurs
- Expertise française historique (40+ ans), 500 000 clients
- Solutions sectorielles spécialisées (retail, immobilier, etc.)
À savoir
- Tarification souvent sur devis, peu transparente
- Interface parfois datée sur certains modules
- Implémentation complexe pour les solutions ERP

SAGE
Alternative solideSage est un éditeur britannique historique fondé en 1981, devenu l'un des leaders mondiaux des logiciels de gestion d'entreprise. En France, ses solutions Sage 100, Sage Business Cloud et Sage X3 équipent plus de 250 000 entreprises. Dans le cadre de la réforme 2026, Sage a développé Sage Network, sa Plateforme Agréée (PA) certifiée par l'administration fiscale et intégrée nativement sans surcoût dans toutes ses solutions de gestion. Cette PA garantit l'émission et la réception conformes des factures électroniques aux formats réglementaires (Factur-X, UBL, CII). Sage Network se distingue par son écosystème collaboratif unique connectant votre entreprise aux clients, fournisseurs, banques et administrations, avec hébergement SecNumCloud en France garantissant la souveraineté des données. Les entreprises Sage bénéficient d'une transition simplifiée avec mise à jour automatique vers la conformité 2026.
Points forts
- Marque de confiance, millions d'utilisateurs dans le monde
- Gamme très large : Sage 50, 100, X3, etc.
- Écosystème de partenaires et intégrateurs dense
À savoir
- Interfaces parfois vieillissantes selon les produits
- Migration entre versions Sage parfois complexe
- Tarification module par module qui s'additionne
Alternatives
Tableau comparatif
| Outil | Facturation | Français | Mobile | API | CRM | Compta | Illimité |
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Comment choisir son logiciel pour une structure multi-entités ?
La gestion multi-sociétés nécessite des fonctionnalités spécifiques. Voici les critères à prioriser.
Critères essentiels multi-segments
5 points positifs
- Gestion multi-SIREN avec paramétrage TVA distinct par entité
- Facturation inter-sociétés automatisée (une vente génère un achat)
- Tableaux de bord consolidés avec vision groupe
- Gestion des droits d'accès granulaire par société
- Plan comptable et axes analytiques personnalisables par entité
Points d'attention
4 points d'attention
- Vérifiez le modèle tarifaire : par société, par utilisateur ou forfait groupe
- Attention aux solutions qui limitent le nombre d'entités
- Méfiez-vous des fausses solutions multi-sociétés (simple duplication)
- Vérifiez la gestion des devises si vous avez des entités internationales
Notre conseil
- Pour une structure multi-entités, le critère clé est la vraie gestion multi-sociétés (pas une simple duplication de comptes). Testez spécifiquement la facturation inter-sociétés : quand une filiale facture la holding, le système doit automatiquement générer l'écriture d'achat côté holding. C'est le test ultime d'une vraie solution groupe.
Questions fréquentes
Questions fréquentes
Informations vérifiées le 05/02/2026
- Logiciel comptabilité multi-sociétés - Yooz — Yooz
- ERP Multi-société - Grafe — Grafe
- Liste officielle des PA/PDP — DGFIP - Registre officiel






