Meilleur logiciel Facturation Agréé pour l'industrie agroalimentaire
Pourquoi ce comparatif pour l'agroalimentaire ?
L'industrie agroalimentaire a des besoins spécifiques en matière de facturation électronique : traçabilité des lots (DLC, DLUO, numéros de lot), gestion des GTIN, échanges EDI avec la grande distribution, et conformité aux normes sanitaires.
Le secteur est historiquement mature sur l'EDI grâce aux exigences de la grande distribution. Vos flux EDIFACT existants (ORDERS, DESADV, INVOIC) restent compatibles avec la réforme 2026. Mais il faut choisir une PDP capable de maintenir cette traçabilité tout en assurant la conformité administrative.
Nous avons testé 9 solutions adaptées à l'agroalimentaire, en évaluant leur capacité à gérer la complexité des flux (multi-sites, recettes, sous-traitance) et l'intégration avec les ERP métier.
- Test de la gestion des lots, DLC/DLUO et traçabilité alimentaire
- Évaluation de l'intégration EDI grande distribution (GS1, GTIN)
- Analyse de la compatibilité avec les ERP agroalimentaires (Infologic, Akanea, Difagro)
- Vérification du statut PA/PDP sur le registre officiel de la DGFIP
- Test de la gestion des flux multi-sites et sous-traitance
- Évaluation de la réconciliation DESADV/INVOIC pour la traçabilité
Ce classement est établi en toute indépendance. Nous ne percevons aucune commission sur les ventes. Les éditeurs ne peuvent pas payer pour améliorer leur position.
Notre classement

GENERIX Group
Meilleur choixGenerix Group est un éditeur SaaS français spécialisé dans les solutions supply chain et finance depuis plus de 25 ans. Sa plateforme Invoice Services, officiellement immatriculée Plateforme Agréée (PA) n°0002 depuis août 2024, traite plus de 800 millions de factures électroniques annuellement dans 70 pays. La solution couvre l'intégralité des processus Procure-to-Pay et Order-to-Cash avec automatisation complète des workflows, archivage électronique probant, et pilotage par KPI. Generix supporte tous les formats de facturation (EDI, Factur-X, UBL, CII, PDF) sur une plateforme unique et assure la conformité réglementaire internationale incluant CTC, soft/hard clearance, B2B/B2C/B2G mandates, Real Time reporting et SAF-T. Leader reconnu avec 350 interconnexions partenaires et 5000 clients dont Carrefour, Saint-Gobain, Danone et EDF.
Points forts
- Plateforme Agréée (PA) n°0002 officiellement immatriculée par la DGFiP depuis août 2024
- Expertise de 25+ ans avec 800M factures traitées annuellement et conformité dans 70 pays
- Couverture fonctionnelle complète P2P et O2C avec automatisation totale des processus finance
À savoir
- Positionnement entreprise sans tarification publique, réservé aux structures avec volumes importants
- Solution complexe nécessitant accompagnement et formation des équipes
- Pas d'offre gratuite ou freemium pour tester la plateforme

CECURITY
Excellent rapport qualité/prixCecurity.com est une Plateforme Agréée (PA) officiellement immatriculée par la DGFiP pour la réforme 2026. Spécialiste français de la confiance numérique et de l'archivage électronique, Cecurity propose une solution SaaS complète pour la dématérialisation des factures clients et fournisseurs. La plateforme eFacture combine e-invoicing et e-reporting avec hébergement SecNumCloud en France, certification NF-461 et ISO 27001, et signature électronique qualifiée eIDAS. L'offre couvre l'ensemble du cycle : diffusion multicanale automatisée, collecte et extraction automatique des données, modules de validation et approbation, suivi temps réel avec traçabilité complète, archivage à valeur probante pendant 10 ans, et module de paiement intégré pour régler les factures fournisseurs.
Points forts
- PA immatriculée DGFiP avec conformité totale 2026 (e-invoicing et e-reporting) et hébergement SecNumCloud France
- Triple certification NF-461, ISO 27001 et signature eIDAS qualifiée garantissant sécurité maximale
- Solution complète avec extraction automatique données, modules validation/approbation et paiement fournisseurs intégré
À savoir
- Positionnement plutôt orienté ETI/grandes entreprises avec tarification sur devis peu transparente
- Pas d'application mobile pour gestion nomade malgré interface SaaS moderne

AGENA 3000
Alternative solideAGENA3000, éditeur français basé à Cholet depuis 40 ans, propose A3 E-INVOICING, solution de facturation électronique déjà déployée auprès de milliers de sociétés de toutes tailles. Immatriculée Plateforme Agréée (PA) numéro 0001 par la DGFiP, AGENA3000 se positionne comme acteur historique de la dématérialisation EDI avec certification ISO 27001 et cybersécurité renforcée dépassant les exigences gouvernementales. La solution gère e-invoicing B2B/B2G/international et e-reporting B2C, supporte tous formats obligatoires (XML UBL, UN/CEFACT, Factur-X), et s'interface avec 200+ ERP incluant SAP, Sage, Cegid, Microsoft Dynamics, Odoo. Membre actif de la FNFE-MPE, AGENA3000 participe aux échanges avec l'État sur l'évolution réglementaire. Clients référencés : Orlait, Saint-Michel, Soprema, Terrena, France Frais (400 000 factures/an traitées).
Points forts
- Plateforme Agréée numéro 0001 avec 40 ans expertise dématérialisation et milliers clients actifs
- Cybersécurité renforcée dépassant cahier charges gouvernemental ISO 27001 avec politique sécurité stricte
- Intégration native 200+ ERP majeurs garantissant interopérabilité environnements SI complexes existants
À savoir
- Tarification non communiquée publiquement nécessitant demande devis systématique pour évaluation budget
- Positionnement historique EDI impliquant potentiellement courbe apprentissage versus pure players modernes
- Certains développements fonctionnalités encore en cours selon mentions site officiel
Alternatives
Tableau comparatif
| Outil | Facturation | Français | Mobile | API | CRM | Compta | Illimité |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() | |||||||
![]() |
Comment choisir son logiciel pour l'agroalimentaire ?
L'industrie agroalimentaire a des contraintes spécifiques liées à la traçabilité et aux volumes. Voici les critères à prioriser.
Critères essentiels pour l'agroalimentaire
5 points positifs
- Gestion native des lots, DLC/DLUO et traçabilité alimentaire
- Compatibilité EDI GS1 (GTIN, SSCC, DESADV avec infos lots)
- Intégration avec votre ERP métier (Infologic, Akanea, Difagro, ISAGRI)
- Réconciliation automatique DESADV/INVOIC pour la traçabilité
- Gestion multi-sites et flux de sous-traitance
Points d'attention
4 points d'attention
- Vérifiez que les numéros de lot transitent bien dans les factures
- Attention aux solutions qui ne gèrent pas les spécificités DESADV alimentaire
- Prévoyez l'intégration avec votre système de traçabilité existant
- Vérifiez la compatibilité GS1 Sunrise 2027 (codes 2D)
Notre conseil
- Pour l'agroalimentaire, la traçabilité est non négociable. Privilégiez les solutions qui maintiennent le lien entre vos bons de livraison (DESADV avec lots/DLC) et vos factures. Generix et Agena 3000 sont les références du secteur. Cecurity est excellent pour les PME agroalimentaires.
Questions fréquentes
Questions fréquentes
Informations vérifiées le 05/02/2026
- Guide facture électronique agroalimentaire 2026 — Akanea
- Facturation électronique et monde agricole — ISAGRI
- Liste officielle des PA/PDP — DGFIP - Registre officiel





